细菌16S rDNA 序列比对,
题目
细菌16S rDNA 序列比对,
菌种鉴定中,已测出待定菌种的16SrDNA序列.那么:
1、在NCBI上比对时,有三个属的多个已知菌种与新菌匹配率都95%以上,值最高的那个属其实真的在预料之外,而且文献中也没看到.那么可不可以把新菌鉴定为另一个属呢(也就是max ident相对低一点点,但文献中报道较多的那个?)
2、比对后的匹配率至少要达到多少才有说服力呢(确定为该属)?
3、在比对时,有的尽管匹配率(max ident)高,但匹配值(max score)小,或覆盖率(Query coverage)小.那么按照怎样的轻重顺序综合考虑这些关系呢?
答案
举一反三
我想写一篇关于奥巴马的演讲的文章,写哪一篇好呢?为什么好
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